El Plan de saneamiento divide el país en cuatro sistemas principales de saneamiento tratados de forma independiente. Estos sistemas están diseñados para poder asumir las variaciones demográficas causadas por la fluctuación del número de habitantes debido a la naturaleza turística del país. Las instalaciones de saneamiento se ubican al final de cada una de las cuencas fluviales y son las siguientes
Estación depuradora de aguas residuales del sistema sur
Situada en el punto más bajo del país, junto a la frontera del río Runer, recoge íntegramente las aguas residuales de las parroquias de Sant Julià de Lòria, Andorra la Vella, Escaldes-Engordany y Encamp. Esta instalación, inaugurada en 2004, tiene una capacidad de tratamiento de 30.000 metros cúbicos por día. La depuradora ha sido concebida, con vistas a un futuro crecimiento, para un tratamiento de 100.000 habitantes-equivalentes y ha sido dotada de la más moderna tecnología de telecontrol y gestión.
Estación depuradora de aguas residales del sistema noroccidental
Se encuentra en el núcleo de Anyós. Concebida dentro del Plan de saneamiento del Gobierno de Andorra para el tratamiento de las aguas de las parroquias de La Massana y Ordino, se terminó de construir durante el año 2002 con una capacidad de tratamiento de 15.500 habitantes-equivalentes. Actualmente está en fase de adaptación y ampliación para poder asumir el tratamiento de 40.000 habitantes-equivalentes.
Estación depuradora de aguas residuales del sistema nororiental
Entre el Santuario de Meritxell y Canillo se encuentra la estación de depuración más moderna de Andorra. Inaugurada en 2006 y con una capacidad para 17.000 habitantes-equivalentes, trata el agua procedente de la parroquia de Canillo. Integrada totalmente en el paisaje, la planta ha sido diseñada teniendo en cuenta la gran capacidad turística de la parroquia, que conlleva importantes variaciones del volumen de agua tratada y de su carga contaminante. También se ha tenido en cuenta la baja temperatura del agua. La tecnología adoptada es un tratamiento fisicoquímico con biofiltración en tres etapas
Estación depuradora del sistema Arieja
El sistema Arieja incluye básicamente el núcleo del Pas de la Casa. Ésta fue la primera depuradora que se construyó en Andorra, en 1979, y se ha ido ampliando para adaptarla al crecimiento de la población. Actualmente cuenta con una capacidad para 15.000 habitantes-equivalentes y eliminación de nutrientes.
Secado térmico
El secado térmico de fangos está integrado en las instalaciones de la EDAR Sur y, en funcionamiento normal, trata los residuos que ésta genera. Esta instalación, inaugurada en 2004, tiene una capacidad de evaporación de 20.600 kg. de agua al día. Una vez secos, los fangos se gestionan en el Centro de tratamiento de residuos.